Dentro a una misteriosa struttura dotata di un'area verde sono ospitati dei ragazzini. Durante una verifica, Tokio riceve un fugace messaggio che recita: "Vorresti andare all'esterno dell'esterno?", e da quel momento comincia a chiedersi come sia il mondo al di fuori. Altrove, Maru e Kiruko, impegnati in una quotidiana lotta per la sopravvivenza in ciò che resta del Giappone, sono alla ricerca del "paradiso"...
Nel corso del loro viaggio, Maru e Kiruko sono incappati in un edificio sulla cui insegna compare lo stesso simbolo disegnato sulla pistola del raggio kiru, e decidono così di avventurarsi al suo interno. Intanto, nel "paradiso", Aoshima è stata promossa a vicedirettrice dopo aver informato la direttrice scolastica dello "strano cambiamento di Tokio", ma quella che si trova ad affrontare è per lei una situazione inedita e ancora misteriosa...